Le chakra apparaît dans de forme différente. Le plus souvent, le chakra est bleu mais pour les ninjas médicaux leurs chakra est de couleur verte. Naruto utilise le chakra rouge de Kyuubi pour défendre ces proches.
Le chakra bleu est le chakra normale utiliser par tout les ninja. Il est aussi sous plusieurs formes différente : Concentration, air de chakra (le Shinra Tensei), une boule nommée Orbe tourbillonant, chidory (forme éclair)ou des paumes que Hinata a employée pour sauver Naruto de Pain.
Le chakra vert est le chakra médical, il permet de soigner plusieurs ninja en quelque minutes, leurs utilisateurs sont ; Tsunade, Shizune, Sakura et les différent médecins.
Le chakra rouge est le chakra des Bijuu que montre le plus souvent Naruto et Kyuubi lors du combat contre Haku ou Pain. Le chakra de Kyuubi est employée chez Naruto : Pour sauver ces proches.
Le chakra violet est le chakra de la marque maudite d'Orochimaru employés le plus souvent par Sasuke et Juugo lors du Mangaka.
Mais il a aussi des natures de chakra différente. Tel que les natures rares.
-Katon (feu)
-Suiton (eau)
-Fuuton (vent)
-Raiton (foudre)
-Doton (terre)
-Mokuton (bois)
-Hyõton (glace)
-Ranton (orage)
-Yõton (dissolution)
-Futton (vapeur)
-Enton (brasier)
-Shõton (cristal)
-Shakuton (incendies)
-Bakuton (explosions)
-Jiton (champs magnétiques)
-Meiton (ténèbres)
-Koton (acier)
-Jinton (poussière,vitesse)
-Ninjutsu médical (médecine)
-Technique basique (permutation, dédoublement, Métamorphose dénouer les liens)
Et aussi plusieurs type de techniques.
-Ninjutsu (basée sur les techniques normaux)
-Kinjutsu (basée sur les techniques interdites)
-Genjutsu (basée sur les techniques d'ilusions)
-Taijutsu (basée sur les techniques de corps a corps)
-Senjutsu (basée sur les techniques d'ermites)
-Fuinjutsu (basée sur les techniques de scellement)
-Kuchiyose (basée sur les techniques d'invocation)